Etienne commence sa carrière chez Dow où il a occupe des postes à responsabilités croissantes en France, en Suisse et en Allemagne. Il rejoint ensuite la société française SPIE comme directeur de la stratégie avant de devenir directeur général adjoint d'Emerson Europe en Belgique. Il déménage à Paris comme Vice-Président Exécutif d'AXA à la tête des Systèmes d'Information du Groupe et rapidement assume des responsabilités supplémentaires comme Président d'AXA Group Solutions. En 2008, il devient Chief Executive Officer d'AXA Technology Services puis Head of Group Technology Infrastructure Services chez UBS à Zürich, Suisse. Jusqu'à fin 2020, Etienne Aubourg était le DSI du Groupe L'Oréal basé à Paris. Avant cela, il était le directeur de l'information du groupe Compass basé à Londres.
